Czyszczenie przestrzeni międzyzębowych to jedna część kompletnej pielęgnacji jamy ustnej. Do przestrzeni międzyzębowych bowiem nie dostaną się włókna żadnej szczoteczki międzyzębowej. Czyszczenie szczoteczką międzyzębową bywa bardzo łatwe – wystarczy jeden ruch tam i z powrotem w każdej szczelinie. Rozmiar szczoteczek międzyzębowych można wybrać po konsultacji z higienistką stomatologiczną, dentystą albo ze specjalistami w sklepach Profimed. Do przestrzeni między przednimi zębami trzeba zazwyczaj innego rozmiaru niż do przestrzeni między zębami trzonowymi. Specjaliści również nauczą prawidłowej techniki czyszczenia. Tradycyjnymi producentami szczoteczek międzyzębowych są zwłaszcza szwedzka firma TePe, japoński GUM i szwajcarski Curaprox. Gumowe szczoteczki międzyzębowe ponadto w trakcie czyszczenia musują dziąsła.